Module

Voraussetzungen

Inhalte

- Vorlesung: Molekulargenetische Prozesse und Genregelung, Sequenzen, Sequenzvergleich, pattern matching, Hidden Markov Modelle, Sequenzdatenbanken, phylogenetische Analyse; Modelltypen und Skalenebenen; Kompartimentmodelle; Modellierung von Licht- und Wasserhaushalt in Pflanzenbeständen; individuenorientierte Pflanzenmodelle, Modellierung der Pflanzenarchitektur, L-Systeme, Struktur-Funktions-Modelle von Pflanzen; Artificial Life; Populationsmodelle (Räuber-Beute-Modelle), räumliche Modelle von Ökosystemen, zelluläre Automaten; sozioökonomische Modelle, globale Stoffkreislaufmodelle. - Übung: Vertiefung des Vorlesungsstoffes anhand einfacher Beispiele und Aufgaben, Einführung in die Programmierung mit einer regelbasierten Sprache in einer Open-Source-Simulationsumgebung, Lösung einfacher Modellierungsaufgaben (Pflanzenarchitektur, metabolische Prozesse, Population). / - Lectures: Processes of molecular genetics and gene regulation, sequences, comparison of sequences, pattern matching, hidden Markov models, sequence databases, phylogenetic analysis; model types and scale levels; compartment models; modelling light distribution and water balance in plant stands; individual-oriented plant models, modelling of plant architecture, L-systems, functional-structural models of plants; Artificial Life; population models (predator-prey models), spatial models of ecosystems, cellular automata; socio-economic models, global models of matter transport. - Exercises: Deepening of the content of the lectures by simple examples and tasks, introduction to programming with a rule-based language in an open-source simulation environment, solution of simple modelling tasks (plant architecture, metabolic processes, population).

Lernziele

Kenntnisse über grundlegende Probleme, Methoden, Algorithmen und technische Lösungsansätze der Bioinformatik und der Pflanzen- und Ökosystemmodellierung; die Fähigkeit, Publikationen im Bereich der Landnutzung, die auf diese Methoden zurückgreifen, verstehen und besser bewerten zu können; Kompetenz in der eigenen Implementation einfacher Simulationsmodelle in einer auf biologische Anwendungen angepassten, regelbasierten Sprache (praktische Übungen). / Knowledge about basic problems, methods, algorithms and technical approaches in bioinformatics and in the modelling of plants and ecosystems; the ability to understand publications in the field of land use which refer to these methods (including their better evaluation); competences in the own implementation of simple simulation models in a rule-based language which is fitted to biological applications (practical exercises).

Prüfungsleistung

1. Belege (unbenotet), 2. mündliche Prüfung (benotet), falls 1. bestanden. / 1. written work, (without grading); 2. oral exam (with grading), if 1. was successfully passed

Bemerkungen

Sollte ab WS 2008/09 angeboten werden. Der Modulverantwortlicher hat die BTU verlassen. Studiengang: Landnutzung und Wasserbewirtschaftung.